MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1 plasmid pWCFS103

Total Repeats: 698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006377	CTA	2	6	76	81	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006377	TAC	2	6	88	93	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006377	TTC	2	6	210	215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006377	TAG	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307186
5	NC_006377	TCT	2	6	342	347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307186
6	NC_006377	CCA	2	6	389	394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307186
7	NC_006377	CTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307186
8	NC_006377	TTC	2	6	515	520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307186
9	NC_006377	ATC	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307186
10	NC_006377	TTG	2	6	611	616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006377	A	6	6	679	684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006377	A	6	6	712	717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006377	T	6	6	743	748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006377	GGC	2	6	775	780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006377	T	6	6	828	833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006377	A	6	6	850	855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006377	GAAA	2	8	891	898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006377	TTC	2	6	1056	1061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307187
19	NC_006377	CT	3	6	1086	1091	0 %	50 %	0 %	50 %	54307187
20	NC_006377	TCT	2	6	1143	1148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307187
21	NC_006377	CAA	2	6	1195	1200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307187
22	NC_006377	CCA	2	6	1203	1208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307187
23	NC_006377	CTTT	2	8	1210	1217	0 %	75 %	0 %	25 %	54307187
24	NC_006377	T	7	7	1215	1221	0 %	100 %	0 %	0 %	54307187
25	NC_006377	TTGAC	2	10	1231	1240	20 %	40 %	20 %	20 %	54307187
26	NC_006377	CTA	3	9	1340	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006377	TCG	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006377	ACC	2	6	1414	1419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_006377	CTA	2	6	1451	1456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006377	A	6	6	1456	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006377	TAG	2	6	1467	1472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006377	TGTT	2	8	1493	1500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006377	ACC	2	6	1544	1549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_006377	CAC	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_006377	TTG	2	6	1602	1607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006377	ATA	2	6	1709	1714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006377	GGTG	2	8	1761	1768	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006377	T	7	7	1769	1775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006377	GTT	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006377	GAA	2	6	1956	1961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006377	ATC	2	6	2003	2008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006377	ACA	2	6	2109	2114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307188
43	NC_006377	A	7	7	2154	2160	100 %	0 %	0 %	0 %	54307188
44	NC_006377	GAT	2	6	2235	2240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307188
45	NC_006377	CTTG	2	8	2258	2265	0 %	50 %	25 %	25 %	54307188
46	NC_006377	AAG	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307188
47	NC_006377	A	7	7	2371	2377	100 %	0 %	0 %	0 %	54307188
48	NC_006377	AAT	2	6	2385	2390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307188
49	NC_006377	ATTTG	2	10	2459	2468	20 %	60 %	20 %	0 %	54307188
50	NC_006377	AT	3	6	2579	2584	50 %	50 %	0 %	0 %	54307188
51	NC_006377	AGA	3	9	2696	2704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307188
52	NC_006377	GAAA	2	8	2711	2718	75 %	0 %	25 %	0 %	54307188
53	NC_006377	A	7	7	2802	2808	100 %	0 %	0 %	0 %	54307188
54	NC_006377	ATT	2	6	2841	2846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54307188
55	NC_006377	TGG	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54307189
56	NC_006377	AAT	2	6	2904	2909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307189
57	NC_006377	GCCCCA	2	12	2925	2936	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	54307189
58	NC_006377	TCT	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307189
59	NC_006377	CAAA	2	8	2969	2976	75 %	0 %	0 %	25 %	54307189
60	NC_006377	TAC	2	6	3012	3017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307189
61	NC_006377	ATC	2	6	3032	3037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307189
62	NC_006377	A	6	6	3039	3044	100 %	0 %	0 %	0 %	54307189
63	NC_006377	CTCAA	2	10	3078	3087	40 %	20 %	0 %	40 %	54307189
64	NC_006377	A	6	6	3110	3115	100 %	0 %	0 %	0 %	54307189
65	NC_006377	T	7	7	3117	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	54307189
66	NC_006377	AAT	2	6	3209	3214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307189
67	NC_006377	GAC	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006377	CA	3	6	3281	3286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006377	A	6	6	3286	3291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006377	TAT	2	6	3298	3303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006377	TACA	2	8	3332	3339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006377	CAAT	2	8	3394	3401	50 %	25 %	0 %	25 %	54307190
73	NC_006377	ACTTA	2	10	3408	3417	40 %	40 %	0 %	20 %	54307190
74	NC_006377	A	6	6	3421	3426	100 %	0 %	0 %	0 %	54307190
75	NC_006377	CCAC	2	8	3428	3435	25 %	0 %	0 %	75 %	54307190
76	NC_006377	TG	3	6	3455	3460	0 %	50 %	50 %	0 %	54307190
77	NC_006377	ATTCA	2	10	3497	3506	40 %	40 %	0 %	20 %	54307190
78	NC_006377	ACA	2	6	3516	3521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307190
79	NC_006377	ATA	2	6	3546	3551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307190
80	NC_006377	GTA	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006377	TAAA	2	8	3727	3734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006377	TAA	2	6	3752	3757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006377	ATTA	2	8	3781	3788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006377	TGCG	2	8	3841	3848	0 %	25 %	50 %	25 %	54307191
85	NC_006377	ATC	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307191
86	NC_006377	ATCTG	2	10	3917	3926	20 %	40 %	20 %	20 %	54307191
87	NC_006377	TCA	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307191
88	NC_006377	AAC	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307191
89	NC_006377	CTT	2	6	3995	4000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307191
90	NC_006377	AAC	2	6	4129	4134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307191
91	NC_006377	CG	3	6	4157	4162	0 %	0 %	50 %	50 %	54307191
92	NC_006377	AGT	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307191
93	NC_006377	T	6	6	4283	4288	0 %	100 %	0 %	0 %	54307191
94	NC_006377	ATTTG	2	10	4315	4324	20 %	60 %	20 %	0 %	54307191
95	NC_006377	TTAT	2	8	4383	4390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006377	A	6	6	4437	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006377	GAAG	2	8	4582	4589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006377	ATCGA	2	10	4603	4612	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_006377	AAG	2	6	4618	4623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006377	TC	3	6	4760	4765	0 %	50 %	0 %	50 %	54307192
101	NC_006377	TAG	2	6	4843	4848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307192
102	NC_006377	AAC	2	6	4869	4874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006377	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006377	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006377	A	6	6	4996	5001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006377	ATA	2	6	5010	5015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006377	T	6	6	5052	5057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006377	AAT	2	6	5128	5133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006377	GCC	2	6	5181	5186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_006377	A	6	6	5278	5283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006377	GAA	2	6	5293	5298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006377	ATT	2	6	5303	5308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006377	TGC	2	6	5328	5333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006377	TATTT	2	10	5334	5343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006377	TAT	2	6	5381	5386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54307193
116	NC_006377	AGTTG	2	10	5445	5454	20 %	40 %	40 %	0 %	54307193
117	NC_006377	CAC	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307193
118	NC_006377	TCAT	2	8	5517	5524	25 %	50 %	0 %	25 %	54307193
119	NC_006377	AAG	2	6	5544	5549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307193
120	NC_006377	TTG	2	6	5557	5562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307193
121	NC_006377	TGT	2	6	5593	5598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307193
122	NC_006377	CCAAAA	2	12	5607	5618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307193
123	NC_006377	TAT	2	6	5657	5662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006377	ATT	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54307194
125	NC_006377	TG	3	6	5801	5806	0 %	50 %	50 %	0 %	54307194
126	NC_006377	CCA	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307194
127	NC_006377	TTG	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307194
128	NC_006377	AAGG	2	8	5899	5906	50 %	0 %	50 %	0 %	54307194
129	NC_006377	GCA	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307194
130	NC_006377	ATT	2	6	5970	5975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54307194
131	NC_006377	TGA	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307194
132	NC_006377	GAA	2	6	6025	6030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307194
133	NC_006377	GTT	2	6	6046	6051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307194
134	NC_006377	A	7	7	6062	6068	100 %	0 %	0 %	0 %	54307194
135	NC_006377	ATT	2	6	6073	6078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54307195
136	NC_006377	TGC	2	6	6092	6097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54307195
137	NC_006377	GTCC	2	8	6114	6121	0 %	25 %	25 %	50 %	54307195
138	NC_006377	TAA	2	6	6208	6213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307195
139	NC_006377	GAT	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307195
140	NC_006377	CGAT	2	8	6330	6337	25 %	25 %	25 %	25 %	54307195
141	NC_006377	TGG	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54307195
142	NC_006377	TA	4	8	6465	6472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006377	GAG	2	6	6492	6497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006377	ATT	2	6	6542	6547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54307196
145	NC_006377	T	6	6	6550	6555	0 %	100 %	0 %	0 %	54307196
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280	NC_006377	CAA	2	6	12495	12500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307202
281	NC_006377	GTTT	2	8	12561	12568	0 %	75 %	25 %	0 %	54307202
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283	NC_006377	T	6	6	12613	12618	0 %	100 %	0 %	0 %	54307202
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390	NC_006377	T	7	7	18391	18397	0 %	100 %	0 %	0 %	54307209
391	NC_006377	TCA	2	6	18514	18519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307209
392	NC_006377	TA	3	6	18527	18532	50 %	50 %	0 %	0 %	54307209
393	NC_006377	T	6	6	18542	18547	0 %	100 %	0 %	0 %	54307209
394	NC_006377	TCC	2	6	18558	18563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
395	NC_006377	TCT	2	6	18626	18631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307210
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398	NC_006377	GTGCT	2	10	18667	18676	0 %	40 %	40 %	20 %	54307210
399	NC_006377	CTGG	2	8	18724	18731	0 %	25 %	50 %	25 %	54307210
400	NC_006377	TAA	2	6	18847	18852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307210
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403	NC_006377	CT	3	6	18938	18943	0 %	50 %	0 %	50 %	54307210
404	NC_006377	GTC	2	6	19136	19141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54307210
405	NC_006377	CTC	2	6	19177	19182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54307210
406	NC_006377	TCA	2	6	19214	19219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307210
407	NC_006377	TGG	2	6	19235	19240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54307210
408	NC_006377	TGA	2	6	19253	19258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307210
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410	NC_006377	TCA	2	6	19280	19285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307210
411	NC_006377	AAT	2	6	19286	19291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307210
412	NC_006377	TGA	2	6	19308	19313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307210
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414	NC_006377	AAT	2	6	19342	19347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307210
415	NC_006377	TAC	2	6	19357	19362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307210
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500	NC_006377	A	6	6	25106	25111	100 %	0 %	0 %	0 %	54307216

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